La famille des Gekkonidae contient environ 1000 espèces réparties dans cinq sous-familles. Cette classification peut largement varier selon les auteurs. Les espèces de cette famille sont parfois classées dans d'autres familles (Carphodactylidae, Diplodactylidae, Eublepharidae, Phyllodactylidae et Sphaerodactylidae).
En Europe vivent 5 ou 6 espèces en plus d'une espèce introduite :
- Sous-famille : Aeluroscalabotinae -

- Sous-famille : Diplodactylinae -

- Sous-famille : Eublepharinae -

- Sous-famille : Gekkoninae -
- Espèce : Cyrtopodion heterocercus (Blanford, 1874)

- Espèce : Cyrtopodion kotschyi (Steindachner, 1870)

- Espèce : Euleptes europaea (Gené, 1839)

- Espèce : Hemidactylus frenatus Fitzinger, 1826

- Espèce : Hemidactylus turcicus (Linné, 1758)

- Espèce : Tarentola bischoffi Joger, 1984

- Espèce : Tarentola mauritanica (Linnaeus, 1758) - tarente ou tarente de Maurétanie

- Sous-famille : Teratoscincinae -
